Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrif1Q923B3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nrif1Q923B3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nrif1Q923B3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nrif1Q923B3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nrif1Q923B3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms