Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Smarca5Q91ZW3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Smarca5Q91ZW3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Smarca5Q91ZW3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Smarca5Q91ZW3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Smarca5Q91ZW3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms