Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpe65Q91ZQ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpe65Q91ZQ5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpe65Q91ZQ5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpe65Q91ZQ5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rpe65Q91ZQ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpe65Q91ZQ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms