Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc49Q91YK0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc49Q91YK0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrc49Q91YK0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrc49Q91YK0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms