Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcdha9Q91Y11 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pcdha9Q91Y11 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcdha9Q91Y11 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcdha9Q91Y11 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pcdha9Q91Y11 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha9Q91Y11 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha9Q91Y11 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha9Q91Y11 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha9Q91Y11 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcdha9Q91Y11 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms