Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vps36Q91XD6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps36Q91XD6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps36Q91XD6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps36Q91XD6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps36Q91XD6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms