Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prb1Q91X93 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prb1Q91X93 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prb1Q91X93 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prb1Q91X93 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prb1Q91X93 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms