Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx11Q91WL6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snx11Q91WL6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx11Q91WL6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx11Q91WL6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx11Q91WL6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms