Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmx1Q8VBT0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmx1Q8VBT0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmx1Q8VBT0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmx1Q8VBT0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms