Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4H2

Arhgef12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef12Q8R4H2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Arhgef12Q8R4H2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Arhgef12Q8R4H2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Arhgef12Q8R4H2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Arhgef12Q8R4H2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Arhgef12Q8R4H2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Arhgef12Q8R4H2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Arhgef12Q8R4H2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Arhgef12Q8R4H2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
Arhgef12Q8R4H2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Arhgef12Q8R4H2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Arhgef12Q8R4H2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Arhgef12Q8R4H2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Arhgef12Q8R4H2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Arhgef12Q8R4H2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms