Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc80Q8R2G6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc80Q8R2G6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc80Q8R2G6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms