Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z0

Lgi2, Leucine-rich repeat LGI family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi2Q8K4Z0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lgi2Q8K4Z0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lgi2Q8K4Z0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lgi2Q8K4Z0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lgi2Q8K4Z0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgi2Q8K4Z0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lgi2Q8K4Z0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lgi2Q8K4Z0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lgi2Q8K4Z0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lgi2Q8K4Z0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lgi2Q8K4Z0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lgi2Q8K4Z0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgi2Q8K4Z0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgi2Q8K4Z0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgi2Q8K4Z0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgi2Q8K4Z0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lgi2Q8K4Z0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgi2Q8K4Z0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lgi2Q8K4Z0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lgi2Q8K4Z0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms