Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim68Q8K243 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim68Q8K243 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim68Q8K243 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim68Q8K243 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim68Q8K243 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
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