Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZS0

Lin7a, Protein lin-7 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7aQ8JZS0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lin7aQ8JZS0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lin7aQ8JZS0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lin7aQ8JZS0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lin7aQ8JZS0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lin7aQ8JZS0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lin7aQ8JZS0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lin7aQ8JZS0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lin7aQ8JZS0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms