Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CopaQ8CIE6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CopaQ8CIE6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CopaQ8CIE6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CopaQ8CIE6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms