Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cdkl1Q8CEQ0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms