Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp27Q8CEG8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp27Q8CEG8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Usp27Q8CEG8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp27Q8CEG8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp27Q8CEG8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms