Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc178Q8CDV0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc178Q8CDV0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc178Q8CDV0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc178Q8CDV0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms