Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RybpQ8CCI5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RybpQ8CCI5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RybpQ8CCI5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RybpQ8CCI5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms