Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrip1Q8CBD1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nrip1Q8CBD1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nrip1Q8CBD1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nrip1Q8CBD1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nrip1Q8CBD1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nrip1Q8CBD1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms