Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac7Q8C2B3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hdac7Q8C2B3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac7Q8C2B3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac7Q8C2B3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac7Q8C2B3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
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