Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa22Q8C1N8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Defa22Q8C1N8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa22Q8C1N8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa22Q8C1N8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms