Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdsp2Q8BX07 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctdsp2Q8BX07 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctdsp2Q8BX07 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctdsp2Q8BX07 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms