Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcl3Q8BVF2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pdcl3Q8BVF2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pdcl3Q8BVF2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pdcl3Q8BVF2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pdcl3Q8BVF2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms