Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rccd1Q8BTU7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rccd1Q8BTU7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rccd1Q8BTU7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rccd1Q8BTU7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rccd1Q8BTU7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rccd1Q8BTU7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rccd1Q8BTU7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rccd1Q8BTU7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rccd1Q8BTU7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rccd1Q8BTU7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rccd1Q8BTU7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rccd1Q8BTU7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rccd1Q8BTU7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms