Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap20Q8BTU1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap20Q8BTU1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cfap20Q8BTU1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cfap20Q8BTU1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cfap20Q8BTU1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cfap20Q8BTU1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap20Q8BTU1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap20Q8BTU1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms