Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PcgF3Q8BTQ0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PcgF3Q8BTQ0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PcgF3Q8BTQ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms