Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abraxas1Q8BPZ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abraxas1Q8BPZ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abraxas1Q8BPZ8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abraxas1Q8BPZ8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms