Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c4Q8BMQ2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c4Q8BMQ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gtf3c4Q8BMQ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gtf3c4Q8BMQ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms