Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ckap4Q8BMK4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ckap4Q8BMK4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ckap4Q8BMK4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ckap4Q8BMK4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms