Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMJ8

Sp8, Transcription factor Sp8, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp8Q8BMJ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Sp8Q8BMJ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Sp8Q8BMJ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Sp8Q8BMJ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Sp8Q8BMJ8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27,14■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27,12■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Sp8Q8BMJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,92
Sp8Q8BMJ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Sp8Q8BMJ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Sp8Q8BMJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Sp8Q8BMJ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Sp8Q8BMJ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Sp8Q8BMJ8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,4 ms