Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AtripQ8BMG1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AtripQ8BMG1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AtripQ8BMG1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AtripQ8BMG1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
AtripQ8BMG1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AtripQ8BMG1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AtripQ8BMG1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AtripQ8BMG1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AtripQ8BMG1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AtripQ8BMG1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AtripQ8BMG1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms