Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ankrd55Q8BLD6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ankrd55Q8BLD6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ankrd55Q8BLD6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd55Q8BLD6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.6 ms