Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nup93Q8BJ71 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup93Q8BJ71 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup93Q8BJ71 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nup93Q8BJ71 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms