Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
D130040H23RikQ8BII3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
D130040H23RikQ8BII3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
D130040H23RikQ8BII3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
D130040H23RikQ8BII3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
D130040H23RikQ8BII3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms