Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD8

Pcmtd2, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd2Q8BHD8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcmtd2Q8BHD8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcmtd2Q8BHD8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcmtd2Q8BHD8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcmtd2Q8BHD8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms