Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rnf41Q8BH75 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rnf41Q8BH75 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rnf41Q8BH75 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rnf41Q8BH75 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rnf41Q8BH75 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms