Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
U2af1l4Q8BGJ9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
U2af1l4Q8BGJ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms