Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trmt12Q8BG71 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trmt12Q8BG71 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trmt12Q8BG71 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trmt12Q8BG71 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms