Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctdspl2Q8BG15 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctdspl2Q8BG15 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ctdspl2Q8BG15 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctdspl2Q8BG15 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctdspl2Q8BG15 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms