Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cracr2bQ80ZJ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cracr2bQ80ZJ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cracr2bQ80ZJ8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cracr2bQ80ZJ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cracr2bQ80ZJ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cracr2bQ80ZJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cracr2bQ80ZJ8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cracr2bQ80ZJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cracr2bQ80ZJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cracr2bQ80ZJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms