Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR4

Znf598, E3 ubiquitin-protein ligase ZNF598, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf598Q80YR4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Znf598Q80YR4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Znf598Q80YR4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Znf598Q80YR4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Znf598Q80YR4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms