Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35,9■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Kdm5bQ80Y84 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35,84■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC35,84■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,83■■■■□ 3,33
Kdm5bQ80Y84 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35,79■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Kdm5bQ80Y84 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC35,76■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC35,74■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,73■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35,73■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC35,73■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC35,72■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35,71■■■■□ 3,31
Kdm5bQ80Y84 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC35,67■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35,65■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC35,64■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,64■■■■□ 3,3
Kdm5bQ80Y84 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC35,63■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC35,61■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35,6■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,29
Kdm5bQ80Y84 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC35,57■■■■□ 3,28
Kdm5bQ80Y84 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Kdm5bQ80Y84 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC35,56■■■■□ 3,28
Kdm5bQ80Y84 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC35,55■■■■□ 3,28
Kdm5bQ80Y84 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Kdm5bQ80Y84 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,55■■■■□ 3,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms