Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sestd1Q80UK0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sestd1Q80UK0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sestd1Q80UK0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sestd1Q80UK0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms