Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Otop3Q80UF9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Otop3Q80UF9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Otop3Q80UF9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Otop3Q80UF9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Otop3Q80UF9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms