Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc93Q7TQK5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc93Q7TQK5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc93Q7TQK5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc93Q7TQK5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms