Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Uhrf2Q7TMI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uhrf2Q7TMI3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Uhrf2Q7TMI3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Uhrf2Q7TMI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms