Protein–RNA interactions for Protein: Q791N7

Znrd1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrd1Q791N7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znrd1Q791N7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Znrd1Q791N7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Znrd1Q791N7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Znrd1Q791N7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znrd1Q791N7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Znrd1Q791N7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms