Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GypcQ78HU7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GypcQ78HU7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GypcQ78HU7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GypcQ78HU7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GypcQ78HU7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms