Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ube2d2bQ6ZWY6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2d2bQ6ZWY6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms